A bacia hidrográfica do rio Jundiaí-Mirim apresenta um total de 1889 ha de Áreas de Preservação Permanente, no entorno dos seus corpos d´água (córregos, lagos e nascentes). Desse total, 60% estão ocupados com vegetação natural, e o restante, por outras formas de ocupação que estão em desacordo com a nova Lei Florestal.
Na Figura 25 tem-se a distribuição relativa das áreas de vegetação natural, por sub bacia hidrográfica, dentro das Áreas de Preservação Permanente.
Como uma forma de orientar o poder público na gestão e implantação de projetos de restauração de áreas de preservação permanente, elaborou-se um mapa com as áreas de preservação permanente, consideradas prioritárias para recuperação, como ilustrado na figura 26 abaixo. O mapa das áreas prioritárias para recuperação de APPs pode ser consultado em “Downloads”.